BA.1-sublineage自然感染患者中和抗体とワクチン接種の中和抗体の、その後発生したsublineageへの中和抗体能の比較
今後、 BA.4/5-sublineageへの変遷が予想される。完璧とは言えないが、ブースターワクチン接種を促進し、他のsublieage対応ワクチンの早期適用が望まれる。
Neutralization of Omicron sublineages and Deltacron SARS-CoV-2 by 3 doses of BNT162b2 vaccine or BA.1 infection
Chaitanya Kurhade, et al.
doi: https://doi.org/10.1101/2022.06.05.494889
https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2022.06.05.494889v2
本研究では、SARS-CoV-2ウイルスBA.1-, BA.2-, BA.2.12.1-, BA.3, BA.4/5-, XD-SのmNeonGreen（mNG）タグ付きSタンパク質を作製した。研究チームは、Vero E6細胞に、野生型（wt）USA-WA1/2020 mNGウイルスと同様に、これらのウイルスの106プラーク形成ユニット/ミリリットル（PFU/ml） を感染させた。
研究チームは、組換えSARS-CoV-2ウイルスを用いて、2つのヒト血清パネルの50%蛍光焦点還元中和力価（FFRNT50）を測定した。最初の血清サンプルは、22人がBNT162b2ワクチンの3回目（PD3）を受けてから1カ月後に採取した。2つ目の血清は、ワクチンを接種していないがオミクロンBA.1亜型に感染した20人の血清から採取したもので、オミクロンBA.1亜型に感染した遺伝子型を確認した。研究者らは、感染したウイルスの遺伝子型をサンガー（Sanger）法を用いて確認した。
BNT162b2 PD3免疫血清のwt WA1に対する幾何平均力価（GMT）は1335と最も高く，BA.1-，BA.2-，BA.2.12.1-，BA.3-，BA.4/5-，XD-S亜種に対するGMTはそれぞれ393, 298, 315, 216, 103, 301となった．PD3血清は，すべてのSARS-CoV-2亜種で一貫して20以下の中和力価を有していた．
オミクロン亜流のS型，BA.1，BA.2，BA.2.12.1，XDは，同じ傾向でBNT162b2の3回投与により誘発されるnAbsを回避した．BA.2.12.1 > BA.2 > BA.1の順で有病率が上昇するのは、SARS-CoV-2の感染性の違いや他の免疫回避のメカニズムによって説明される。また，BNT162b2 PD3血清は，BA.4/5亜型の中和効率が非常に低かった．これらの結果は、BA.3亜型の体力が低下し、BA.4亜型とBA.5亜型がそれに取って代わり、SARS-CoV-2感染の新しい波となる可能性を示唆するものであった。
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BNT162b2ワクチン3回目接種後1カ月に採取した血清による中和（A）と、Omicron BA.1 SARS-CoV-2に感染しワクチン未接種の人から採取した血清による中和（B）。USA-WA1/2020、OmicronサブラインBA.1-, BA.2-, BA.2.12.1-, BA.3-, BA.4/5-, Deltacron XD-spike mNG SARS-CoV-2s に対する中和力価の散布図。
BNT162b2ワクチン接種血清（n=22）およびBA.1感染回復者血清（n=20）の両者を、バリアントスパイクmNG SARS-CoV-2sに対するFFRNT50として検査。バリアントスパイクmNG SARS-CoV-2sは、完全なバリアントスパイク遺伝子をmNG USA-WA1/2020に組み込んで製造されたものである。各データポイントは、示されたウイルスに対する血清標本で得られた幾何平均FFRNT50（GMT）を表す。表S1およびS2に、それぞれ（A）および（B）の血清情報およびFFRNT50をまとめた。個々のバリアントスパイクmNG SARS-CoV-2に対する中和力価は、それぞれ二重アッセイによる2または3の独立した実験において決定した；GMTを提示する。棒の高さおよび上の数値はGMTを示す。ひげは95%信頼区間を示す。点線はFFRNT50の検出限界を示す。統計解析はWilcoxon matched-pairs signed-rank testを用いて行った。(A)のBNT162b2ワクチン接種血清では、USA-WA1/2020と任意のバリアントスパイクSARS-CoV-2のGMT差のP値はすべて<0.0001である。(B)のBA.1発現血清では、BA.1-とXDスパイクウイルス間のGMT差のP値は0.0021、BA.1-と他の変異型スパイクウイルス（USA-WA1/2020を含む）間のGMT差のP値はすべて<0.0001であった。(A)と(B)の両血清パネルについて、個々の血清のFFRNT50値を線でつないで示した。
BA.1感染者血清の中和活性のGMTは、wt WA1に対して15と最も低かったが、BA.1感染者血清の中和活性のGMTは、wt WA1に対して15と最も低かった。しかし，BA.1-, BA.2-, BA.2.12.1-, BA.3-, BA.4/5-, XD-S変異体に対するGMTはそれぞれ430, 110, 109, 102, 25, 284であり，BA.1変異体に対するGMTが最も低かった．しかし，BA.1感染者の血清は，すべてのオミクロン亜型とデルタクロンXDを同様の効率で中和できず，特にBA.4/5は中和できなかった．BA.4/5のS変異F486Vは、これらの亜型が事前の感染によるnAbsをさらに回避するのに役立った可能性がある。
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