COVID−19:ウィルス変異,ワクチン,再感染の影響

従来のSIRモデルの発展型

Modeling COVID-19 transmission between age groups in the United States considering virus mutations, vaccinations, and reinfection

Jyotirmoy Roy, et al.

Scientific Reports volume Published: 22 November 2022

https://www.nature.com/articles/s41598-022-21559-9

COVID-19の異なる年齢層における感染ダイナミクスを深く理解することは，政府および保健当局にとって，パンデミックの有害な影響を軽減するための戦略を考案する上で大きな関心事である．人口バランス方程式に基づくSIRDV-Virulence（Susceptible-Infected-Recovered-Dead-Vaccinated-Virulence）疫学モデルを開発し，ウイルス変異体，ワクチン戦略，「アンチ／ノンヴァクサー」割合，再感染率の影響を調査して，米国人口におけるCOVID-19感染を緩和する方法を提供することに成功した．公開されたデータに基づいて、パンデミックの広がりを支配する主要なパラメータを求めた。その結果，感染力の強いCOVID-19変異体が存在する場合，感染者の大部分は大人と子供の集団から生まれることが分かった．2021年7月末の状況を考えると、高齢者よりも子供と成人のワクチン接種を優先することで、活発な感染者の拡大を抑え、それによって医療システムの負担を防ぎ、その後の死亡を最小限に抑えることができることが示された。このモデルは、このパンデミックの影響を抑制する唯一の選択肢は、ワクチン未接種者の人口を減らすことであることを示唆している。Anti/Non-vaxxers' の割合が高くなると、再感染率が高くなり、パンデミックの再来につながる可能性がある。

この研究では、3つの異なる年齢層におけるCOVID-19感染と死亡を予測するための新しいコンパートメントモデルを開発。年齢層内および年齢層間の相互作用をシミュレートするために、このモデルは病原性環境によってもたらされる感染を使用、人口収支方程式を使用して導出.まず、このモデルを 2021 年 1 月から 7 月までの COVID-19 の症例、死亡、ワクチン接種のデータに適合。次に、適合モデルを使用して、図1bに示すように、4つのシミュレーションに焦点を当てて、2021年8月から予測。

• まず、デルタ変異株に関連する感染率の増加とワクチンの非効率性が、米国のパンデミックのダイナミクスをどのように変えることができるかを評価。
• 第二に、ワクチンの展開速度と分布を変更した場合の影響を研究して、COVID-19の感染と死亡率を最小限に抑えるための最適なワクチン配布戦略についての洞察。
• 第三に、米国における‘Anti/Non-vaxxers’ の割合を変えることの影響を研究。
• 第四に、モデルに再感染を組み込むことで、その予測がどのように変化するかを研究。

SIRDV-Virulence（Susceptible-Infected-Recovered-Dead-Vaccinated-Virulence）モデルおよび研究の全体プロセスの模式図。(a) 米国におけるCOVID-19の感染を予測するSIRDV-Virulenceモデル（Susceptible-Infected-Recovered-Dead-Vaccinated-Virulence）。3つの年齢グループ（子供、大人、高齢者）のメンバーがコンパートメント間の矢印（青）の隣のパラメータの影響を受けて、速度に応じて移動しています。各年齢グループの感染メンバーは、単一の病原性パラメータ（オレンジ）の成長に寄与し、感受性者ǔ𝑖とワクチン接種者ǔ𝑖の両方に感染させることができる。(b) データをコンパートメントモデルに与えてそのパラメーターを適合させ、シミュレーションを実行して将来のシナリオを予測する。(1) Delta 変異体の影響、(2) ワクチン接種の配分と展開速度の変化の影響、(3) COVID-19 Anti/Non-Vaxxers の割合の影響、および (4) 再感染による影響。

anti/Non-Vaxxerの影響部分

COVID-19 Anti/Non-Vaxxer Effect と PAIRDV-Virulence ( ProVaxxer - AntiVaxxer - Infected - Recovered - Dead - Vaccinated - Virulence ) Model. (a) SIRDV-Virulence ( Susceptible - Infected - Recovered - Dead - Vaccinated - Virulence ) モデルを変形した PAIRDV-Virulence モデルを導入し、感受性集団 ǔ𝑖 をワクチン非接種小集団 ǔ𝑖 とワクチン接種小集団𝑃𝑖 に分割している。(b）ワクチンを接種しない感受性集団の割合𝜔𝑖が増加すると、病原性、感染症、死亡数が増加する（c-h）。各年齢層で𝜔𝑖を同時に変化させた結果、（c, f）高齢者、（d, g）成人、（e, h）子供について予測される感染者数と死亡者数を示している。

www.DeepL.com/Translator（無料版）で翻訳しました。

 

Covid-19再感染でリスク２倍

 Outcomes of SARS-CoV-2 Reinfection

This is a preprint; it has not been peer reviewed by a journal.

Ziyad Al-Aly, Benjamin Bowe, Yan Xie

https://doi.org/10.21203/rs.3.rs-1749502/v1

SARS-CoV-2による最初の感染は、肺および肺外器官系における急性および急性後死および後遺症のリスク増加と関連している。しかし、再感染が最初の感染後に発生したリスクに加わるかどうかは明らかではない。 

米国退役軍人省の全国医療データベースを使用して、最初の感染(n = 257,427)、再感染(2つ以上の感染、n = 38,926)、および非感染対照群(n = 5,396,855)を持つ人々のコホートを構築し、全死因死亡率、入院、および事前に指定された一連のインシデント結果のリスクと6ヶ月の負担を推定。 

最初の感染を有する人々と比較して、再感染が肺およびいくつかの肺外器官系(心血管障害、凝固および血液学的障害、糖尿病、疲労、胃腸障害、腎臓障害、精神的健康障害、筋骨格障害、および神経学的障害)における全原因死亡率、入院、および有害な健康転帰のさらなるリスクに寄与することを示す。 

リスクは、ワクチン接種を受けていない人、1回の予防接種を受けた人、または2回目の感染の前に2回以上の予防接種を受けた人に明らか。 

リスクは急性期に最も顕著であったが、再感染の急性期以降も持続し、再感染後6ヶ月では依然としてほとんどが明らかであった。 

非感染対照と比較して、反復感染の累積リスクの評価は、感染数に応じて段階的にリスクおよび負担が増加することを示した。調査結果の星座は、再感染が再感染の急性期および急性期における全死因死亡率、入院、および健康への悪影響の自明でないリスクを追加することを示している。SARS-CoV-2による死亡や病気の全体的な負担を軽減するには、再感染予防のための戦略が必要。‎

 

Covid-19:若年既感染‘５分の１’に再感染可能性

 

SARS-CoV-2への感染によって誘導された抗体は大部分を保護するが、その後の感染に対して効果的な免疫力を保証するものではないことが、海兵隊の若い新兵を対象とした縦断的なプロスペクティブ研究で明らかになった。血清陽性であることが確認された既感染者は、再感染の可能性があり、既感染の証拠がない者に比べて約5分の1の発生率であった。血清陽性群では、再感染者は非感染者に比べて抗体価が低く、ほとんどの者がベースラインで検出可能な中和抗体を欠いていた。以上の結果から、COVID-19ワクチンの接種は、以前に感染した若年成人におけるパンデミックを抑制するために必要である可能性が示唆された・・・SARS-CoV-2ワクチンの大量接種プログラムが開始され、以前に感染した人の割合が増加していることから、自然感染後の再感染のリスクは、パンデミックのモデル化、集団免疫の推定、ワクチン接種戦略の指針となる重要な問題である。また、若年成人の多くは無症状で感染し、感染が知られていない状態で血清陽性となるため、より脆弱な集団への感染源となる可能性がある。この年齢層の既感染者にワクチンを接種する必要性を判断するためには、血清陽性によってもたらされるSARS-CoV-2感染に対する保護を評価することが重要である。血清陽性の若年成人は、血清陰性者と比較して後続感染のリスクが約 5 分の 1 であった。初感染で誘導された抗体は大部分を保護するが、SARS-CoV-2の効果的な中和活性やその後の感染に対する免疫力を保証するものではない。これらの知見は、集団予防接種戦略の最適化に関連する可能性がある。

https://www.newswise.com/coronavirus/new-study-finds-reinfection-by-sars-cov-2-in-healthy-young-adults-is-common

SARS-CoV-2 seropositivity and subsequent infection risk in healthy young adults: a prospective cohort study

Andrew G. Letizia, et al.

doi: https://doi.org/10.1101/2021.01.26.21250535

medRxiv

https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2021.01.26.21250535v1

This article is a preprint and has not been certified by peer review [what does this mean?]. It reports new medical research that has yet to be evaluated and so should not be used to guide clinical practice.

背景 血清陽性の若年成人における重症急性呼吸器症候群コロナウイルス2(SARS-CoV-2)のその後の感染リスクをプロスペクティブに検討した。

方法 研究対象者は、18~20 歳の海兵隊新兵 3,249 名であった。海兵隊管理下の2週間の検疫所に到着した参加者は、ベースラインでSARS-CoV-2 IgGの血清陽性があるかどうかを評価され、receptor binding domain and full-length spike proteinの酵素免疫吸着法(ELISA)で1:150以上の希釈度と定義された。SARS-CoV-2 感染は、隔離の開始時、中間時、終了時に PCR で評価した。検疫中に PCR 陽性者を含む適切な除外を行った後、検疫を離れて基礎訓練に入った参加者に対して、血清陽性群と血清陰性群の両方で隔週 3 回の PCR 検査を実施し、その後感染した血清陽性者と血清陽性者の中から選ばれた感染していない参加者のベースライン中和抗体価を測定した。

所見 血清陽性者189人のうち、19人(10.1%)が6週間の追跡期間中にSARS-CoV-2のPCR検査で少なくとも1回の陽性を示した(1人年あたり1.1例)。一方、血清陰性者2,247人のうち1,079人(48.0%)が陽性であった(1人年あたり6.2例)。発生率比は 0.18(95%CI 0.11~0.28、p<0.00001)であった。

血清陽性の参加者では、感染はベースラインの full-length spike protein IgG値の低下と関連していた(p<0.0001)。血清陰性者と比較して、血清陽性者はウイルス負荷(ORF1ab gene、p<0.005)が約10倍低く、PCR陽性期間が短く(p=0.18)、無症状の感染が多い傾向にあった(p=0.13)。

血清陽性者では,6週間の観察期間中に,ベースラインの中和力価が非感染者54人中45人(83.3%),感染者19人中6人(31.6%)で検出された(ID50差p<0.0001).

解釈 血清陽性の若年成人は、血清陰性者と比較して、その後の感染リスクが約5分の1であった。初感染時に誘導された抗体は大部分を保護するが,SARS-CoV-2の効果的な中和活性や,その後の感染に対する免疫力を保証するものではない。これらの知見は、集団予防接種戦略の最適化に関連している可能性がある。

www.DeepL.com/Translator(無料版)で翻訳しました。

コロナ再感染

中国武漢ウィルス

<hr>IDSAのガイドライン　最近　アップデートされていた

Infectious Diseases Society of America Guidelines on the Treatment and Management of Patients with COVID-19

Published by IDSA on 4/11/2020. Last updated, 8/20/2020

https://www.idsociety.org/practice-guideline/covid-19-guideline-treatment-and-management/

<hr>

世間で、ワクチンが効かないなど、集団免疫の意味が無いだの騒いでいるようだが・・・原著を見たいものだ

香港男性がコロナ再感染、2種類のウイルス株確認　世界初の実証

ロイター

［香港　２４日　ロイター］ - 香港大学の研究者は２４日、新型コロナウイルス感染症から回復した男性が４カ月半後に再感染したことを確認したと発表した。実証された再感染のケースとしては世界初。研究者は、集団免疫が獲得されても、ウイルスの流行が継続する可能性を示唆しているとの見方を示した

https://news.yahoo.co.jp/pickup/6369199

https://nationalpost.com/news/world/scientists-confirm-first-official-case-of-coronavirus-re-infection-in-a-hong-kong-man

“Our findings suggest that SARS-CoV-2 may persist in humans,” Kwok-Yung Yuen and colleagues said Monday in a paper accepted for publication in the journal Clinical Infectious Diseases. The findings are reminiscent of the coronaviruses that cause the common cold, and suggest SARS-CoV-2 may continue to circulate “even if patients have acquired immunity via natural infection or via vaccination,” they said.

文献はここのはずだが・・・速報版なし

https://academic.oup.com/cid

<hr> 再感染無症状というところが救いか

Covid-19: Hong Kong scientists report first confirmed case of reinfection

BMJ 2020; 370 doi: https://doi.org/10.1136/bmj.m3340 (Published 26 August 2020)

Cite this as: BMJ 2020;370:m3340

https://www.bmj.com/content/370/bmj.m3340.short?rss=1

香港の33歳の男性が、Covid-19の再感染が初めて確認されたと報告されています。

香港大学医学部微生物学教室の研究者らは、この患者の2つのエピソードは、明らかに異なるゲノム配列を持つウイルス株によって引き起こされたことを発見しました。その結果はまだ発表されていませんが、8月24日にClinical Infectious Diseases誌に掲載されました。

"この男性が最初にこの感染症を発症したのは3月のことで、おそらくロンドンから一緒に仕事をしに来た同僚から感染したものと思われます。その時、彼は非常に軽い症状を持っていたし、コビド19の陽性反応を示した。"と、研究チームのメンバーであり、大学医学部の臨床教授でもあるイワン・ファン・ンガイ・フン氏は述べている。

"香港でCovid-19の陽性が確認されたすべての患者は、観察、対症療法、感染予防のために入院しており、2回陰性となるまで3週間入院していました」とHung氏は付け加えた。"その後、4ヶ月半後にスペインに1週間滞在していた彼が香港に戻ってきたとき、香港に到着したときに誰もが検査を受けるため、彼は帰国後に検査を受けました。彼は無症状でしたが、それでも陽性反応が出て、かなり高いウイルス負荷を持っていました。

"短命」免疫

研究チームのプレスリリースによると、第1回感染時と第2回感染時のウイルスの間で、合計24個のヌクレオチドが異なっていたという。アミノ酸の違いは9つのタンパク質に見られ、その中には1回目の感染からのウイルスにのみ存在していたORF8タンパク質の58アミノ酸の切り捨てが含まれていた。今回の所見は、自然感染後の後天的な免疫は短命である可能性を示唆している。

"ワクチン接種は、以前に感染した人にはまだ考慮されるべきである "とHung氏は述べた。彼は、開発中のワクチンは「この種の突然変異からはかなり安全である」と指摘した。しかし、ウイルスが大きく変化する可能性があるので、現在試験中のワクチンは効かないかもしれません。

彼は、再感染の証拠は驚くべきものではないと述べ、他のオブザーバーもこの見解を支持している。

イギリスのイースト・アングリア大学の医学教授ポール・ハンターは、「あまり驚くべきことではないはずだ。しかし、これが文書化されることが重要です。コメンテーターは以前から、免疫力は永久的なものになる可能性は低く、数ヶ月しか持たないかもしれないと言ってきました」と述べています。

"軽症者と重症者では抗体反応の強さが異なり、その後のレベルの低下を考えると、軽症者は重症者よりも免疫の持続期間が短くなる可能性があります。"

ワクチン研究への影響について、ロンドン衛生熱帯医学大学院の微生物病原学教授ブレンダン・レン氏は、「世界で300万人以上のコビド-19の症例がある中、SARS-CoV-2への再感染の可能性が報告された最初の症例は、文脈を考慮に入れる必要がある」と述べています。

ウイルスは時間の経過とともに自然に変異することが予想されます。これは非常に稀な再感染例であり、Covid-19ワクチンを開発するための世界的な推進を否定すべきではありません。"

www.DeepL.com/Translator（無料版）で翻訳しました。

<hr>日本の左巻きマスコミは、最後の部分を省略して、ワクチン無効のみを騒ぐのであった