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2019年2月23日土曜日

重症喘息:MKKCクラスター解析



ベースラインと動的変数の変化を含む100変数


入力データよりview1、view2、view3→kernel 1 、kernel 2、 kernel 3 → combined kernel → Clustering
結局12の変数を同定


  • 年齢
  • activity limitation AQLQ
  • 発症時年齢
  • BMI
  • ベースライン気管支拡張剤後FVC
  • 喀痰マクロファージ
  • 特異的IgE数
  • FVCアルブテロール反応
  • ベースライン脈
  • 総白血球数
  • 黒人/アフリカ系アメリカ人
  • 喀痰好酸球



Multiview Cluster Analysis Identifies Variable Corticosteroid Response Phenotypes in Severe Asthma
Wei Wu , et al.
American Journal of Respiratory and Critical Care Medicine
https://doi.org/10.1164/rccm.201808-1543OC       PubMed: 30682261

理論的根拠:Rationale
コルチコステロイド(CSs)は喘息治療に有効だが、反応はまちまち。全身性CS投与は長期副作用をもたらす。CS治療反応寄与要素を理解することが"precision management"促進となるだろう

目的:unsupervised multiple learning apporoachによるCS治療への異なる反応性のsubphenotype同定

方法:Multiple kernel clusteringにてCS反応性の喘息クラスター4型

結果:
Clusters 1 & 2:若年、CS反応性modestで、比較的肺機能温存
ステロイド後喀痰好中球・マクロファージ比率で分類

Cluster 3 :低肺機能晩期発症喘息、ベースラインで血中好酸球増加、ほぼCS反応

Cluster 4 :主に若年肥満、重症気流制限、好酸球少なく、CS反応悪い








CS不応性は・・・肥満高齢女性だったような


Identification of Asthma Phenotypes Using Cluster Analysis in the Severe Asthma Research Program
Wendy C. Moore, et al.
AJRCCM  Vol. 181, No. 4 | Feb 15, 2010

2018年7月21日土曜日

COPD併発症:5つのクラスター分類

COPDでは併発症(合併症)が問題とほざくが、

comorbidome


クラスター的分類は少ない。phenotype毎対応必要な併発症(合併症)


"principal component analysis and a non-hierarchical cluster analysis to describe the cluster of comorbidities”



Comorbidities and COPD severity in a clinic-based cohort
BMC Pulmonary Medicine201818:117
https://doi.org/10.1186/s12890-018-0684-7

コホート:1584名、2年間で登録
COPD重症度分布:Group A 27.4%、Group B 24.7%、Group C 11.2%、 Group D 36.6%

平均年齢 66.5 (SD 11)歳、女性 35%

重症度同じでも併発症によりCOPD管理は異なる
COPD関連併発症無しは僅か28.4%


2つの併発症を有する患者比率は、GOLD A (35.4%)、C (34.3%)に比べ B (50.4%) 、 D  (53.1%)で高い

クラスター解析にて、5つのcomorbidity
cluster 1:心疾患特性
cluster 2:併発症少ない 
cluster 3 :メタボリックシンドローム、無呼吸、不安・うつ
cluster 4 :栄養不良、骨粗鬆症
cluster 5:気管支拡張症

クラスターは、有症状患者であるGOLD B、GOLD Dで有意に多い






心疾患群、栄養不良群、メタボリックシンドローム(無呼吸・うつ/不安)群はわかるが、cluster 5は?

欧米でのCOPDには、びまん性汎細気管支炎・気管支拡張などが紛れ込んでんじゃないかと医者始めた当初から疑ってるんだが・・・


HPVワクチンをめぐる日本の"失われた8年"と、私たちが検証すべきこと

「子宮頸がんワクチン」という呼び方に、以前から違和感があります。 HPVワクチンが子宮頸がん予防に重要であることは間違いありません。日本では女子への定期接種として導入され、子宮頸がん予防を中心に説明されてきたため、この名称が広まった経緯も理解できます。 しかし、このワクチンが...