喘息免疫細胞enhancerマークにcolocalizeするリスクlocus：多家系関連研究

Multiancestry association study identifies new asthma risk loci that colocalize with immune-cell enhancer marks
Florence Demenais, et al.
Nature Genetics 50, 42–53 (2017)
doi:10.1038/s41588-017-0014-7
https://www.nature.com/articles/s41588-017-0014-7

世界中のgenome-wide association関連解析の meta-analysis
(症例　23,948 , 対照118,538 )


５つの新規喘息loucs：

• 5q31.3 NDFIP1, GNDPA1, SPRY4
• 6p22.1 GPXS, TRM21
• 6q15 BACH2, GIA10, MAP3K7
• 12q13.3 STAT6, NAB2, LRP1
• 17q21.33 ZNF652

２つの家系特異的とされた以前関連性locusの新規signal：

• 6q21.33 MICB, HCP5, MCCD1
• 10p1 GATA3, CELF2

２つの喘息＋花粉症合併と報告のあったlocus：

• 8q21.13 TPD52, ZBTB10
• 16p13.13 CLEC6A, DEXI, SOCS1

既知喘息locus：

• 2q12  IL1RL1, IL1RL2, IL18R1
• 5q22.1 SLC25A46, TSLP
• 5q31 IL13, RAD50, IL4
• 6p21.32 HLA-DRB1, HLA-DQA1
• 9p24.1 RANBP6, IL33
• 11q3.5 EMSY, LPRC32
• 15q22.2 RORA, NARG2, BPS13C
• 15q22.33 SMAD3,SMAD6, AAGAB
• 17/q12-21ERBB2, PGAP3, NIEN1

喘息の漆器関連性を示した９つのlocusの主要特性
新規喘息感受性locus：

• 5q31.3 　NDFIP1(intron) IBD
• 6p22.1　Intergenic 肺機能
• 6q14　BACH2(intron) MS、T1D、CD、IBD、IGG
• 12q13.3　STAT6(intron) IgE（総、特異的）、肺機能　Pso、ISP_IFN
• 17q21.33　Intergenc アトピー性皮膚炎

家系特異的な以前から指摘のlocusにおける新規signal ：

• 6p21.33　MIICB(intron) IgE(総ｍ特異的)、自己報告アレルギー、アトピー性皮膚炎、肺機能 SLE、UC、RA、IBD、BS、GD、SS、AS、Pso、UC、V,WBC、MoC、DS、HIV-1、SJS、HB、HBV、IMN、CD4/CD8比、HIV-1C
• 10p14　Intergenic  自己報告アレルギー RA、ISP_IL1B、ISPV

喘息＋花粉症報告のあった喘息signal

• 8q21.13 Intergenic RA
• 16p13.13 CLET16A(Intron) T1D、PBC、MS、RA、IBD、CD、LEP