2019年2月23日土曜日

重症喘息:MKKCクラスター解析



ベースラインと動的変数の変化を含む100変数


入力データよりview1、view2、view3→kernel 1 、kernel 2、 kernel 3 → combined kernel → Clustering
結局12の変数を同定


  • 年齢
  • activity limitation AQLQ
  • 発症時年齢
  • BMI
  • ベースライン気管支拡張剤後FVC
  • 喀痰マクロファージ
  • 特異的IgE数
  • FVCアルブテロール反応
  • ベースライン脈
  • 総白血球数
  • 黒人/アフリカ系アメリカ人
  • 喀痰好酸球



Multiview Cluster Analysis Identifies Variable Corticosteroid Response Phenotypes in Severe Asthma
Wei Wu , et al.
American Journal of Respiratory and Critical Care Medicine
https://doi.org/10.1164/rccm.201808-1543OC       PubMed: 30682261

理論的根拠:Rationale
コルチコステロイド(CSs)は喘息治療に有効だが、反応はまちまち。全身性CS投与は長期副作用をもたらす。CS治療反応寄与要素を理解することが"precision management"促進となるだろう

目的:unsupervised multiple learning apporoachによるCS治療への異なる反応性のsubphenotype同定

方法:Multiple kernel clusteringにてCS反応性の喘息クラスター4型

結果:
Clusters 1 & 2:若年、CS反応性modestで、比較的肺機能温存
ステロイド後喀痰好中球・マクロファージ比率で分類

Cluster 3 :低肺機能晩期発症喘息、ベースラインで血中好酸球増加、ほぼCS反応

Cluster 4 :主に若年肥満、重症気流制限、好酸球少なく、CS反応悪い








CS不応性は・・・肥満高齢女性だったような


Identification of Asthma Phenotypes Using Cluster Analysis in the Severe Asthma Research Program
Wendy C. Moore, et al.
AJRCCM  Vol. 181, No. 4 | Feb 15, 2010

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