"factor X"という言葉は因子解析などから同定されているならわかるが、直感的な思い込みで使われていることが多い。SARS-CoV-2に対する交差防御能を有する既存の記憶T細胞応答がin vivoで増大し、急速なウイルス抑制を促して不稔感染を誘導するという仮説の検証が報告されている。これも主張する人がいれば"factor X"となるのだろうか？
ただ、文中、 ”不稔感染”という言葉を使っているので、これも解釈に混乱をもたらすと思う。
不稔感染： Abortive Infection
微生物学において、バクテリオファージによって細菌細胞が汚染され、その後、ファージ粒子の再生産と細菌の溶解（溶菌）が起こらなくなること。汚染された細胞を様々な物質で処理したり、あらかじめ細菌を飢餓状態にしたり、カルシウムイオンがないなどの影響で、細胞内でのファージの繁殖が阻害されることがある。また、ファージによる汚染が頓挫した細菌変異体も存在する。そのメカニズムは様々である。
医学の世界では、感染症が短期間で終息し、症状がほとんど出ないことを "abortive infection "と呼んでいる。
問題の報告
重症急性呼吸器症候群コロナウイルス2（SARS-CoV-2）に曝露された可能性のある人が、必ずしもPCR陽性や抗体陽性になるわけではない。これは、一部の人ではセロコンバージョン前に不顕性感染が消失する可能性を示唆している。T細胞は、SARS-CoV-2をはじめとするコロナウイルスの感染の迅速な除去に寄与することができる。今回、SARS-CoV-2に対する交差防御能を有する既存の記憶T細胞応答がin vivoで増大し、急速なウイルス抑制を促して不稔感染を誘導するという仮説を立てた。我々は、PCR検査、抗体結合検査、中和抗体検査で繰り返し陰性［血清陰性HCW（SN-HCW）］と判定された、集中的にモニタリングを受けた医療従事者において、SARS-CoV-2反応性T細胞［初期に転写された複製–転写複合体（RTC）に対するものを含む］を測定した。SN-HCWは、パンデミック以前の曝露歴のない人の集団（パンデミック前コホート）と比較して、より強力で多特異的な記憶T細胞を持ち、これらの細胞は、対応付けされた同時的コホートで検出可能な感染後に見られる構造タンパク質が支配的な反応よりも、RTCに対してより頻繁に反応した。最も強力なRTC特異的T細胞を持つSN-HCWでは、SARS-CoV-2のロバストな初期自然免疫シグネチャーであるIFI27が上昇しており、これは不稔感染を示唆する。RTC内のRNAポリメラーゼは、ヒト季節性コロナウイルス（HCoV）やSARS-CoV-2クレードを通じて、高い配列保存性を示す最も大きな領域であった。RNAポリメラーゼは、パンデミック前コホートやSN-HCW由来のT細胞によって（調べた領域の中では）優先的に標的化されていた。SN-HCWでは、HCoV変異株を交差認識するRTCエピトープ特異的なT細胞が見つかった。濃縮されたすでに多く存在するRNAポリメラーゼ特異的T細胞は、顕性のSARS-CoV-2感染と比較して不稔感染だと推定されるSARS-CoV-2感染の後、in vivoで拡大し、記憶応答で優先的に蓄積した。我々のデータは、RTC特異的なT細胞が、エンデミックおよびコロナウイルス科（Coronaviridae）のウイルス科の新興ウイルスに対するワクチンの標的であることを示している。
コロナウィルスにおける replication/transcription complex (RTC) :複製・転写複合体
生命を脅かす重症急性呼吸器症候群を引き起こすSARS-コロナウイルス（SARS-CoV）は、感染した宿主細胞の細胞質で複製を行う。SARS-CoVのライフサイクルにおける重要な初期段階は、ウイルスゲノムの複製とサブゲノムmRNAの合成を駆動する複製・転写複合体（RTC）の形成である。SARS-CoVの複製と転写は、ウイルスにコードされた非構造タンパク質（nsps）を主成分とする;replication/transcription complex (RTC) :複製・転写複合体によって媒介されている。16種類のSARS-CoV nspsは、2つの大きな前駆体ポリタンパク質の自動処理によって生成される。RTCは、SARS-CoV感染細胞の細胞質における特徴的なウイルス誘導性二重膜構造と関連していると考えられている。ウイルスがコードする酵素がこのRTCの中核を形成しており、このRTCは、改変された宿主細胞膜に由来する特徴的なウイルス誘導性膜構造と関連していると考えられている。in vitro反応では、SARS-CoVゲノムRNAと8つのサブゲノムmRNAがすべて合成された。遠心分離により、RTC活性は膜構造、ウイルス酵素、RNAとともに細胞質から単離されることができた。これらの単離されたRTCの活性は、細胞質内の宿主因子に依存していた。RTC活性は洗剤処理によって破壊された。これは、プロテアーゼやヌクレアーゼの消化から複合体を保護すると思われる膜の重要な役割を示唆するものであった。我々のデータは、ウイルスRNA合成と細胞内膜の間の機能的関係を確立し、宿主因子がSARS-CoV RNA合成に重要な役割を果たすことを示している。
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